恽南田的花鸟画以似求不似，画风清新雅丽，其没骨画法风靡一时，追随者众多。他自称“徐家传吾法”，他在继承了徐崇嗣的没骨花卉画法的基础上，又揉合了黄筌、徐崇嗣两家的精髓，重视形象写生，“以花传神”。他的画法是一种“点花粉笔点脂，点后复以染笔足之”的体貌，方薰认为这是“前人未传此法，是其独造”的新风貌，它融工笔与写意之精华为一体，既有工笔画形态逼真，更具写意画的传神。
恽南田创作的山水画题材广泛，大幅求“势”，小幅求“趣”，淡墨、浅色、湿笔，追求幽深、寂静、清新、高逸的情趣。
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